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马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)是侵染烟草的最重要病毒之一。不同PVY株系侵染烟草可引起不同症状,有些PVY株系可引起烟草叶脉坏死,严重影响烟草的产量和品质。PVY A12分离物属于NTN-NW株系,但侵染珊西烟(Nicotiana tabacum cv. Xanthi)不能引起叶脉坏死。分析发现,PVY分离物A12 HC-Pro第182和245位的氨基酸均为精氨酸(R),而能...
甘蔗线条花叶病毒HC-Pro基因的分子变异分析
甘蔗线条花叶病毒 HC-Pro基因 分子变异
2017/10/26
为了解析甘蔗线条花叶病毒Sugarcane streak mosaic virus (SCSMV)不同分离物HC-Pro基因的分子变异规律, 本研究利用RT-PCR法扩增获得SCSMV HC-Pro基因的序列, 通过生物信息学分析, 分别从重组、系统发生、选择压力等方面研究SCSMV HC-Pro基因的分子变异特征。共测定了44条SCSMV HC-Pro基因序列, 相似性最低值为70%; HC-P...
大豆花叶病毒（soybean mosaic virus，SMV）病是全球最主要的大豆病害之一，严重危害大豆的产量和品质。RNA干扰(RNA interference,RNAi)能够在mRNA水平特异性沉默同源靶基因，为抗病毒作物的培育提供了新的途径。本研究对国内外11个不同SMV流行株系的HC-Pro基因进行了核苷酸序列比对，并以SC3株系的cDNA为模板克隆出高度保守的268 bp的基因片段，进...
利用番木瓜环斑病毒（PRSV）HC-Pro 基因3′端824 bp 区段，通过OZ-LIC 法构建了含有PDK 内含子的发夹RNA 编码结构，并选用pSP73 和M-Jm109LacY 分别作为宿主载体和宿主菌，构建了高效的同源dsRNA 原核表达工程菌M-Jm109LacY/pSP73-RNAi-H824，经IPTG 诱导表达的dsRNA 不被DNase I 和RNase A 降解，稳定性较好。...
中国大豆花叶病毒HC-Pro基因的克隆与序列分析
大豆花叶病毒 HC-Pro基因 基因克隆 序列分析
2015/9/24
通过反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR），克隆了我国6个大豆花叶病毒（SMV）分离物的HC-Pro基因全长cDNA，并测定了其全序列，探索其与病毒致病性和交叉保护作用的关系。结果表明：HC-Pro基因全长为1371nt，编码的HC-Pro蛋白为457个氨基酸，其中包含与病毒移动有关的CCC基序、与蚜传相关的PTK基序等功能结构域。6个SMV分离物的HC-Pro基因核苷酸序列同源性为89.2%~9...