搜索结果: 1-11 共查到“作物遗传学 EST-SSR”相关记录11条 . 查询时间(0.109 秒)
一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用
小麦 EST-SSR标记 遗传图谱 RIL
2021/4/7
为了丰富小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。从前期利用小麦转录组数据鉴定出的8 389个EST-SSR序列中，随机选取585对引物得分大于95的标记进行分析，以川麦42和川农16杂交后自交获得的重组自交系群体为试验材料，利用新开发出的EST-SSR标记，并结合SSR标记和SRAP标记，构建了一张遗传图谱。结果表明，585对EST-SSR引...
厚朴转录组特征分析及EST-SSR标记的开发
厚朴 转录组 Illumina-Solexa测序技术 EST-SSR
2020/3/10
为探明厚朴的基因组信息,开发合适的生物学工具以促进厚朴的遗传育种,本研究利用Illumina-Solexa测序技术对厚朴根、茎皮、叶不同组织的9个样本进行转录组分析,获得大量的序列信息,并以转录组序列为基础进行厚朴SSR分子标记的大规模发掘。结果表明,共获得了109 526条厚朴转录组序列,平均序列长度为1 023 bp,通过与蛋白数据库NR、Swiss-Prot、GO、KOG和KEGG五个数据库...
利用EST－SSR标记分析西南扁穗牛鞭草种质的遗传多样性
扁穗牛鞭草 EST－SSR 遗传多样性
2012/3/22
利用禾谷作物EST－SSR标记对采自我国西南地区的40份野生扁穗牛鞭草和3份扁穗牛鞭草国审品种的遗传变异和亲缘关系进行了研究。试验筛选出23对引物对43份供试材料进行扩增，共获得323条带，其中多态性条带261条，多态性条带比率（PPB）达80.4％，多态信息含量（PIC）为0.354～0.500，平均值为0.474，遗传相似系数（GS）为0.690～0.913，表现出丰富的遗传多样性。聚类分析结...
基于EST-SSR的木薯分子标记遗传连锁图谱的构建
EST-SSR 木薯分子 标记遗传 连锁图谱
2011/10/19
此实验以木薯推广品种‘KU50’为母本，‘SC124’为父本通过杂交得到包含240个单株的F1分离群体，利用300对EST-SSR引物，20对SSR和20对SRAP引物组合对亲本和部分群体株系进行多态性分子标记筛选，共获得具有多态性的引物110对。在此基础上，利用这110对多态性引物对该F1群体进行分子标记的多态性分析，共获得269个多态性标记。利用JoinMap 3.0软件对这269个多态性标记...
木薯基因组SSR和EST-SSR在麻疯树和橡胶树中的通用性分析
麻疯树 橡胶树 通用性 EST-SSR
2011/6/7
利用木薯的419对EST-SSR引物和182对基因组SSR引物在5个麻疯树品系和2个橡胶树品系中进行通用性分析。结果显示，木薯EST-SSR在麻疯树和橡胶树中的通用性比例分别为55.85%和38.90%，而木薯基因组SSR在麻疯树和橡胶树中的通用性比例分别为37.36%和26.37%。由此推测，EST-SSR的通用性高于基因组SSR。此外，木薯EST-SSR和基因组SSR的通用性在麻疯树中高于在橡...
芝麻EST-SSR标记的开发和初步研究
芝麻 表达序列标签 (EST) 简单重复序列(SSR) 多态信息含量(PIC) 遗传多样性
2009/10/30
为了加速分子标记在芝麻研究中的应用，利用网上现有的芝麻EST(expressed sequence tags)数据信息，开展了芝麻EST-SSR功能性标记的开发和利用研究。 在所有的3 328条芝麻EST序列中共确认得到1 785条非冗余EST序列。其中，在含有微卫星重复的148条序列中共检测有155个EST-SSR。非冗余EST序列总长为774.266 kb，平均每4.99 kb含有一个EST-...
【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列（2006.4.18—2007.2.4）进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软件进行遗传作图。【结果】在265 362条普通小麦EST序列中,共发现6 314个SSR,占整个E...
[目的] 探讨国内外的24 份普通小麦品种间的遗传差异。[方法] 以改进的酚-氯仿法提取国内外24份普通小麦品种基因组
DNA，采用Genomic-SSR 和EST-SSR标记技术分析24份小麦品种的遗传多样性，并对2种评价方法进行分析比较。[结果] 采用37 对
Genomic-SSR 引物对24份小麦基因型的38个位点进行扩增，24个位点共扩增出152个多态性片段，每个位点上平均片段数为5...
适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记
大豆疫霉菌 表达序列标签（EST） SSR标记 通用性
2009/2/28
【目的】开发大豆疫霉菌SSR标记，为深入了解大豆疫霉菌遗传变异提供理想分析工具。【方法】用SSRIT软件对28 197条大豆疫霉菌EST进行SSR搜索，选择含有SSR的合适EST设计、合成引物和PCR扩增。【结果】发现1 454条EST含有SSR，其中3个碱基重复基元类型最多，有855个，占鉴定总数的54.3%。设计合成140对引物，用10个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR检测，有111对引物...
Recent advances in genomic technologies have generated a large number of expressed sequence tags (ESTs) in cotton. Many of these ESTs are available in public databases, which offer an opportunity to i...
海岛棉EST-SSR引物的开发与应用研究
海岛棉 表达序列标签(EST) 简单序列重复(SSR) 遗传多样性 遗传连锁图
2013/10/9
现有的棉花EST-SSR引物大都开发于中棉和陆地棉, 尚没有海岛棉EST-SSR开发研究的报道. 本研究从实验室构建的海岛棉纤维发育的cDNA文库中先取98条EST序列设计了119对EST-SSR引物. 在这些SSR中, 三核苷酸重复基序AAG含量最为丰富, 达11.76%. 用36份材料(13份A基因组二倍体材料, 11份D基因组二倍体材料和12份AD基因组异源四倍体材料)评价新EST-SSR引...