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中国科学院西北高原生物研究所专利：青藏扁蓿豆EST-SSR遗传标记位点和相应标记引序列及其应用
中国科学院西北高原生物研究所 专利 青藏扁蓿豆 EST-SSR 遗传标记位点 标记引序列
2024/6/27
中国科学院西北高原生物研究所专利：青藏扁蓿豆EST-SSR遗传标记位点和相应标记引序列及其应用。
2022年9月28日，从国家知识产权局获悉，武汉植物园药用植物资源学科组“巫山淫羊藿及其易混物种的EST-SSR分子鉴定方法”获国家发明专利授权。专利号:ZL201910434725.4，发明人：张燕君，于东悦，梁琼，王瑛，杨路路。
一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用
小麦 EST-SSR标记 遗传图谱 RIL
2021/4/7
为了丰富小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。从前期利用小麦转录组数据鉴定出的8 389个EST-SSR序列中，随机选取585对引物得分大于95的标记进行分析，以川麦42和川农16杂交后自交获得的重组自交系群体为试验材料，利用新开发出的EST-SSR标记，并结合SSR标记和SRAP标记，构建了一张遗传图谱。结果表明，585对EST-SSR引...
龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析
无患子科 龙眼 SSR 转录组
2019/8/6
基于龙眼品种‘香脆’果实的转录组测序数据库，开发龙眼EST-SSR引物，评价其在无患子、红毛丹、荔枝、龙荔等4个近缘属植物上的通用性，并进行无患子科5个属55份种质的遗传多样性分析。在13 934条龙眼Unigene中搜索到SSR位点6 683个，SSR发生频率为47.96%，平均分布距离为4.48 kb；单、二和三核苷酸重复是主要的SSR类型，分别占52.78%、26.25%和20.19%；设计...
利用SRAP和EST-SSR分析香椿资源的遗传多样性
香椿 遗传多样性 SRAP EST-SSR
2018/6/15
利用SRAP和EST-SSR标记技术对中国9省10个香椿居群的遗传多样性和亲缘关系进行了分析，试图为香椿种质资源的保护和开发利用奠定基础。结果表明，33对SRAP标记共扩增出167个多态性位点，平均每对引物产生5.06个多态性位点；45对EST-SSR引物共检测到221个多态性位点，平均每对引物检测到4.9个多态位点；所选香椿居群的等位基因数和期望杂合度（EST-SSR，Na = 2.3506，H...
越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析
越橘 分子标记 EST-SSR 遗传多样性
2018/11/23
以84份越橘种质为材料, 从NCBI公共数据库下载22 402条越橘属(Vaccinium) EST序列, 通过CAP3组装软件将EST序列拼接成11 541条unigene序列, 其中2 076条unigene序列含有2 679个SSR位点。二核苷酸和三核苷酸重复是主要的SSR类型, 约占SSR总数的96.01%。利用Primer Premier 5.0软件设计81对引物, 其中55对引物在供试...
厚朴转录组特征分析及EST-SSR标记的开发
厚朴 转录组 Illumina-Solexa测序技术 EST-SSR
2020/3/10
为探明厚朴的基因组信息,开发合适的生物学工具以促进厚朴的遗传育种,本研究利用Illumina-Solexa测序技术对厚朴根、茎皮、叶不同组织的9个样本进行转录组分析,获得大量的序列信息,并以转录组序列为基础进行厚朴SSR分子标记的大规模发掘。结果表明,共获得了109 526条厚朴转录组序列,平均序列长度为1 023 bp,通过与蛋白数据库NR、Swiss-Prot、GO、KOG和KEGG五个数据库...
基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析
刺梨 SSR 遗传多样性 居群遗传结构
2017/11/24
通过分析评价贵州野生刺梨（Rosa roxburghii Tratt）资源居群遗传多样性和遗传结构，为刺梨资源的保护和发掘利用提供科学依据。【方法】从刺梨EST-SSR引物中筛选扩增效果好、多态性较高的10对引物，对收集的12个野生刺梨自然居群（共255份资源）的遗传多样性及遗传结构应用POPGENE 1.31软件进行分析,并根据Nei’s标准遗传距离，利用NTSYS-pc2.10e软件对各居群进...
采用10对EST-SSR引物和9个果实品质性状指标对收集的220份野生刺梨（Rosa roxburghii Tratt）资源的遗传多样性进行分析，结果表明：10对EST-SSR引物共扩增出多态性条带27条，多态百分率为76.67%；9个品质性状中平均单果质量、可滴定酸、固酸比、维生素C和类黄酮含量的变异系数达到20%以上；说明该220份贵州野生刺梨种质资源遗传变异丰富，遗传多样性分布范围较广，适于...
通过转录组测序技术鉴别普通油茶(Camellia oleifera) EST-SSR位点, 开发筛选适用于普通油茶种质资源评价与利用的多态性SSR标记, 对普通油茶的遗传变异研究和油茶良种的分子标记辅助育种具有重要意义。利用 MISA 工具从普通油茶转录组67 434条Unigenes (63.39 MB)中筛选得到26 751个包含1~6个核苷酸重复类型的SSR位点, SSR的分布频率为39.6...
基于荧光检测技术的多花黑麦草EST-SSR指纹图谱的构建
多花黑麦草 EST-SSR分子标记 指纹图谱 荧光检测 毛细管电泳
2017/11/24
构建基于EST-SSR荧光标记的多花黑麦草（Lolium multiflorum Lam.）DNA指纹鉴定体系，为多花黑麦草品种鉴定提供高通量技术手段，为不同品种的合理应用提供参考依据，有效保护农民利益和育种权益。【方法】利用表型性状差异大的3个品种（特高Tetragold、长江2号ChangjiangNo.2和阿伯德Aubade），通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从200对EST-SSR引物中筛选出扩增条...
菊花EST-SSR标记开发及其对万寿菊的可转移性研究
菊花 EST-SSR 万寿菊 可转移性
2017/12/4
为开发菊花EST-SSR标记并用于万春菊资源分析,研究了菊花的EST-SSR特征、标记开发及其在万寿菊上的可转移性。结果表明,菊花EST-SSR出现频率为5.35%,平均每10.64 kb存在1个SSR位点。在这些SSR位点中,共有83种重复基元,2-6核苷酸重复类型分别为10、40、14、5和14种。以14个菊花品种DNA为模板,22对菊花EST-SSR引物中14对可以扩增到清晰且稳定的PCR产...
绵羊脑、卵巢源EST-SSR标记与产羔数、初生重的关联性分析
绵羊 简单重复序列 表达标签 繁殖性状
2014/9/26
为了筛选与绵羊产羔数和初生重基因座紧密连锁的分子标记。本研究选择6个多态性丰富的绵羊脑、卵巢源EST-SSR位点，检测了德国美利奴与中国美利奴杂交F2代196只母羊的遗传多态性，分析了分子标记与产羔数、初生重的关联性。结果表明：6对绵羊脑、卵巢源EST-SSR多态位点在该群体中共检测到23个等位基因，群体杂合度在0.585 1~0.776 6，PIC值均大于0.5,属于高度多态位点，其中11471...
An EST-SSR marker, bu099658, and its potential use in breeding for yellow rust resistance in wheat
Bulk Segregant Analysis (BSA) Marker-Assisted Selection (MAS) Puccinia striiformis f.sp. tritici Triticum aestivum L. Yr1
2014/3/31
EST-SSR markers, derived from the A and B genomes of wheat were used to identify molecular markers associated with yellow rust resistance. For this purpose, bulk segregant analysis was performed using...