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本研究对亲本海7124、中棉所36及47个子代纤维发育5,10和15天的转录组数据分析,鉴定到35420个表达基因,构建了纤维伸长相关动态表达调控网络,其中10366个表达基因在子代中产生新等位基因(ENAs);进一步鉴定到7个时空特异调控表达基因簇,差异表达分析筛选到105个候选基因,包含15个新等位基因。CRISPR-cas9系统敲除GhMAH1使纤维显著变短。本研究为解析陆海群体纤维长度变异...
A pangenome aims to capture the complete genetic diversity within a species and reduce bias in genetic analysis inherent in using a single reference genome. However, the current linear format of most...
Identification of the right parental combinations to maximize heterosis is the major goal of hybrid breeding, which could be achieved through identification of heterotic groups. The main objective of ...
本研究基于全基因组分析,在雷蒙德氏棉、亚洲棉、海岛棉和陆地棉基因组中分别鉴定得到16、16、31和29个NF-YA基因。通过进化树分析将NF-YA基因分为4个亚组。结构分析表明NF-YA基因在棉属进化过程中相对保守。荧光定量显示GhNF-YAs可能通过ABA和 MeJA的调控通路响应盐和干旱。VIGS沉默GhNF-YA10和GhNF-YA23的表达,能显著降低棉花对盐的抗性,表明这两个基...
ATBS1 INTERACTING FACTORs (AIFs)基因是一类bHLH蛋白,在植物生长发育过程中起着重要作用。本研究在亚洲棉、雷蒙德氏棉、陆地棉和海岛棉中分别鉴定得到8, 11, 16和15 AIFs。在该家族基因启动子中发现了多个与生长发育、胁迫和激素相关的启动元件。转录组数据显示该家族基因在棉花的花器官和纤维中高量表达。荧光定量表明该家族基因在纤维起始阶段高量表达。激素处理显示该家...
本研究利用收集的436份国内外变异广泛的陆地棉材料,采用全基因组重测序方法,构建了群体的SNP变异图谱,通过对包含136份早熟棉资源在内的356份陆地棉材料进行深度重测序,并结合公共数据库中的80份陆地棉材料共获得了10,118,884个高质量的SNPs。利用全基因组关联分析(GWAS)鉴定到控制陆地棉早熟性的307个显著遗传位点和重要调控基因。两个早熟遗传热点区域位于 D03和A05&...
To understand the genetic basis of nitrogen and phosphorus uptake in the cultivated rice, quantitative trait loci (QTL) analysis for 7 nitrogen and phosphorus uptake-related traits including above-gro...
Sweet cherry cultivars display a self-incompatibility system that restricts self-fertilization and fertilization between cultivars bearing identical S-alleles. PCR-based S-allele typing system for swe...

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