搜索结果: 1-15 共查到“兽医学 芯片”相关记录33条 . 查询时间(0.062 秒)
旨在研究马身猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系和家系结构。本研究利用Illumina CAUPorince 50 K SNP芯片检测39头保种马身猪的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）；采用Plink软件计算最小等位基因频率、多态信息含量、观察杂合度和期望杂合度，分析保种群体的遗传多样性；采用Plink软件构建状态同源（identity by st...
旨在比较简化基因组测序技术和基因芯片技术实施基因组选择的基因组估计育种值（GEBV）准确性。本研究在AH肉鸡资源群体F2代中随机选取395个个体（其中公鸡212只，母鸡183只，来自8个半同胞家系），同时采用10×SLAF测序技术和Illumina Chicken 60K SNP芯片进行基因标记分型。采用基因组最佳无偏估计法（GBLUP）和BayesCπ对6周体重、12周体重、日均增重、日均采食量...
利用猪1.4M高密度SNP芯片检测巴马香猪全基因组拷贝数变异
巴马香猪 拷贝数变异 1.4M高密度SNP芯片
2021/3/11
旨在检测巴马香猪基因组上的拷贝数变异（CNV），并探究标记密度对于CNV检测效率和准确率的影响。本研究利用319头巴马香猪（其中阉公猪160头和母猪159头）1.4M高密度SNP芯片的数据，采用PennCNV和R-Gada两种软件进行CNVs检测；然后通过重叠CNV融合法，构建拷贝数变异区域（CNVR），并用全基因组关联分析（GWAS）对频率大于5%的CNVR进行验证；最后根据不同的标记密度，均匀...
10种猪常见病毒基因芯片检测方法的建立及初步应用
猪病毒 PCR 基因芯片 检测
2019/1/16
旨在建立一种可同步检测猪10种常见疫病病毒，猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV）、猪瘟病毒（classical swine fever virus，CSFV）、猪伪狂犬病病毒（pseudorabies virus，PRV）、猪圆环病毒2型（porcine circovirus 2，PCV2）、猪...
旨在筛选鸡不同部位（背部和腿部）皮肤组织中的差异表达基因，探讨二者皮肤毛囊出现表型差异的分子机制。以处于上市日龄的（63日龄）商品代肉鸡为素材，利用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对皮肤厚度、毛囊密度和直径出现显著差异的背部和腿部皮肤组织mRNA表达水平进行检测，对与皮肤毛囊发生发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查，并运用实时荧光定量PCR技术对部分差异表达基因进行验证。结果显示，芯片分析共...
对猪病毒性腹泻检测芯片的两种样品标记方法进行比较。分别选取猪流行性腹泻病毒（PEDV）的S和M基因，猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）的N和S基因，A型猪轮状病毒（GAR）的VP7和NSP4基因设计引物，用PCR扩增制备靶基因，纯化后制备猪病毒性腹泻联合检测基因芯片。提取样品核酸，采用Cy3直接标记法和间接标记法进行PCR扩增标记，标记的样品再与芯片杂交、扫描和数据分析，同时对两种标记方法的特异性、敏...
猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)是三种常见的仔猪病毒性腹泻病原，作者拟构建可同时检测三种病原的cDNA基因芯片。分别根据PEDV基因（S、M）、TGEV基因（S、N）、PoRV基因（VP7、NSP4）的保守区设计引物扩增靶基因，进行PEDV-TGEV-PoRV的cDNA阵列设计，建立了扩增标记探针的多重PCR方法，并对所构建cDNA芯片的特异性、...
旨在探索低密度芯片标记的筛选方法并评估不同低密度芯片的准确性。本研究采用BovineHD高密度芯片，检测西门塔尔牛基因组的SNP位点及其与饱和脂肪酸含量的关联性，根据P值或效应值筛选标记构成低密度芯片，使用IBS聚类分组和随机分组进行交叉验证，估计基因组育种值并评估其准确性。结果表明，在14号染色体的MYC基因附近有5个位点与饱和脂肪酸性状显著相关，可考虑作为西门塔尔牛脂肪酸含量的候选基因进行后续...
对生长速度长期的高压选择导致了快大型肉鸡与优质型地方鸡显著的表型差异，本研究旨在研究这种表型差异的分子遗传机理。采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对达到性成熟的优质型清远麻鸡（112 d）和快大型科宝肉鸡(42 d)比目鱼肌中与肌纤维发育和类型组成相关的候选基因及信号通路进行系统筛查。结果，芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 318个，以科宝肉鸡作为参照，清远麻鸡中上调基因501个，...
表达谱芯片筛选獭兔毛色相关候选差异表达基因
獭兔 毛色 差异表达基因 基因芯片
2015/5/28
本研究旨在了解青紫蓝色獭兔和白色獭兔毛色形成的分子遗传学机理。试验分为3组，每组包含全同胞青紫蓝獭兔和白色獭兔各1只。利用安捷伦基因芯片技术分析不同分组之间差异基因表达情况，并通过实时荧光定量PCR方法对部分差异显著基因进行验证。差异表达分析结果显示，3组青紫蓝色獭兔对白色獭兔分别筛选出545、1 680和2 092个差异表达基因 (Differentially expressed genes，D...
利用基因芯片分析鸡法氏囊差异表达基因
鸡 基因表达谱 法氏囊 差异表达基因
2014/9/26
为了解鸡法氏囊发育过程中转录组的变化，应用鸡基因表达谱芯片对从18胚龄、10和30日龄SPF鸡法氏囊组织抽提和纯化的mRNA进行芯片杂交，对差异表达基因进行了GO功能分类和KEGG信号通路分析，并利用荧光定量PCR验证了部分差异表达基因。结果表明，法氏囊总RNA的基因检出率在79%~85%，30日龄雏鸡与18胚龄鸡胚相比、10日龄雏鸡与18胚龄鸡胚相比和30与10日龄雏鸡相比分别筛选到5 043、...
本研究旨在筛选抗猪瘟病毒相关基因，并分析不同猪瘟抗体水平下这些相关基因在大白和长白猪中的表达差异。首先，基于表达谱芯片技术，采用Agilent猪4×44 K全基因组表达谱芯片，分析4组试验材料（病毒模拟物PolyI:C转染的猪PK15细胞、甲基化酶抑制剂Aza-CdR转染的PK15细胞、PolyI:C及Aza-CdR共同转染的PK15细胞、无处理的mock细胞），获得试验组间显著性差异表达基因。进...
基于时序表达谱芯片挖掘鸡脂肪酸代谢关键调控基因
脂肪酸 表达谱芯片 节点基因 调控通
2014/3/18
不同脂肪酸的代谢产物决定了鸡肉风味的差异，找出影响鸡肌肉组织中脂肪酸代谢的关键调控基因对提高肉品质以及对优质肉鸡新品系选育具有重要意义。本研究对KEGG和Wikipathway数据库中脂肪酸代谢网络进行整合分析，挖掘鸡脂肪酸代谢的关键基因，通过Gene Spring筛选出不同周龄的肌肉组织中表达谱芯片与关键基因共表达的差异基因（Pearson相关系数≥0.9），然后导入Cytoscape进行共表达...
试验借助高密度SNP芯片技术在整个基因组范围内对223头中国西门塔尔牛群体进行基因分型，在SCD1基因上发现7个SNPs位点，对各SNP位点与西门塔尔牛肉质性状进行相关性分析。结果表明， SCD1基因的7个SNPs位点均与大理石花纹等级显著相关（P<0.05或P<0.01）； A10050C、A13655G、C14790T和A15565G 4个位点对剪切力影响显著(P<0.05)；位点A13655...